Ingénieur / Ingénieure de recherche scientifique (H/F)

Le candidat / la candidate intégrera une équipe de recherche spécialisée dans l'étude des mécanismes épigénétiques et transcriptionnels chez les Drosophile. Le projet vise à caractériser l'organisation chromatinienne et l'expression génique lors du développement des ailes de pupe, en combinant des approches de séquençage haut débit (ATAC-seq, Cut&Run, RNA-seq) et d'imagerie (DNA FISH, microscopie confocale).

1. Analyse de la structure chromatinienne et de l'accessibilité génomique :

o Réaliser des expériences d'ATAC-seq et de Cut&Run sur des ailes entières de pupe de drosophile pour cartographier les régions régulatrices et les modifications d'histones.

o Préparer des échantillons pour le séquençage et analyser les données en collaboration avec les bioinformaticiens du projet.

2. Caractérisation de l'expression génique à l'échelle de la cellule unique :

o Isoler des cellules uniques à partir d'ailes pupales pour la préparation de banques RNA-seq et ATAC-seq.

o Participer à l'analyse des données de séquençage pour identifier les profils d'expression et d'accessibilité chromatinienne.

3. Visualisation de l'organisation spatiale du génome :

o Mettre en œuvre des protocoles de DNA FISH pour marquer des séquences d'intérêt proches dans les noyaux des cellules d'ailes pupales.

o Acquérir des images en microscopie confocale et quantifier les distances physiques entre les séquences cibles.